南京大学盐城环保技术与工程研究院（以下简称“研究院”）由南京大学和盐城市人民政府于2010年8月4日签约成立，2011年7月正式投入运行。研究院是南京大学在淮河流域与江苏沿海环保科技成果转化与科技创新的战略基地，也是国家水体污染控制与治理重大专项在淮河流域的重要产业化基地。其宗旨是控制沿海开发对区域环境与近海海洋的污染，发展环保战略新兴产业，保障区域生态健康和饮用水安全，支撑淮河流域与江苏沿海社会经济的可持续发展。