中国科大MBA教育始于1998年，已累计招收MBA 8500余人，EMBA 2200余人；二十多年来，教学质量不断提高，品牌影响力不断扩大。毕业生遍布全国各地，大部分走上了更高级领导和管理岗位，收入水平和职业声望显著提升。

2010年10月，教育部授予中国科大MBA教育综合改革试点院校（全国仅有18所）；2013年4月中国科大以优异成绩通过MBA教育综合改革试点验收；2012年12月中国科大MBA教育综合改革成果获安徽省教学成果特等奖；2014年7月中国科大MBA教育综合改革成果获国家级教学成果二等奖。2014年11月中国科大管理学院顺利通过国际精英商学院（AACSB）认证，是全球首家按最新标准，同时也是中国大陆少数通过国际精英商学院(AACSB)认证的学院，已跻身国际精英商学院之列。2016年3月管理学院顺利通过AMBA国际认证并获得五年（最长的）认证周期。

中国科大管理学院MBA/EMBA招生秉承“创造管理思想与工具，培养管理英才与领袖”的学院使命；以能力、社会责任及综合潜质为导向，致力于招收具有一定管理基础和经历、远大职业理想和社会责任的管理者和学习能力出色的考生。